海軍作戰部隊組織未來會將現行雄風系列反艦飛彈部隊及未來要成立的岸置魚叉飛彈部隊,以及相關涉及濱海作戰任務的相關部隊,都整合併入「濱海作戰指揮部」。對於未來防務,海軍司令部參謀長邱俊榮今日於立法院答詢時表示,作戰目標是結合平戰轉換,範圍並非只有24浬。
長期閒置旗津碼頭的中海軍艦,在去年9月決標經費約7200萬的「中海艦基礎維護及現況調查計畫」,台南市政府並曾表示願意協助接收。但根據國防部向立法院提交的預算解凍報告顯示,海軍指出未來若「仍」無地方政府接收活化再利用,將請文化部辦理中海艦古物指定廢止作業,意味中海艦未來還是可能被拆除,也間接否定台南市